Introduction a la mycologie
I.Définition: les champignons (mycètes=fungi=mycota) sont des organismes eucaryotes, dépourvus de pigments assimilateurs donc incapable de photosynthèse.
Ils sont hétérotrophes, menant une vie saprophyte ou parasitaire Ils sont thallophytes (app végétatif: thalle “mycélium”)
II.Morphologie:
a-la paroi cellulaire : constituée de cellulose (monde végétal) ou de chitine (monde animal)
b-l’appareil végétatif = thalle: constitué d’un ensemble de filaments (hyphes) qui sont de différents types:
1.Thalles levuriforme: thalle unicellulaire, cas de levures
2.Thalles filamenteux (mycélien) :
- Thalle siphonné: pas de cloisonnement cas des fungi inférieurs (siphonomycétes)
- Thalle septé (cloisonnée): les articles communiquent entre eux .Cas des fungi supérieurs (septomycètes)
PS! Articles = fragments de filaments
Cas particulier des champignons dimorphiques : morphologie différente a l’état parasitaire et a l’état saprophyte:
— 37° in vivo ou GDS: état de levure / — 25° in vitro sur GS: état filamenteux
A l’œil nu, le thalle apparait sous forme d’un feutrage (poudre) couvrant la matière organique (ex : fruit pourri)
III.Physiologie: hétérotrophe vis-à-vis du carbone (+parfois glucose, azote..), généralement aérobies, Ph optimum =7
IV.Reproduction :
a- reproduction asexuée: +++ : très répondue dans les conditions de vie favorable, seul mode de reproduction connu chez les Deutéromycètes (fungi imparfaits) se fait par deux moyens:
1.Bourgeonnement (fragmentation): le thalle initial se scinde en 2 thalles identiques
2.Sporulation: production de spores pouvant être:
- Endogènes: spores formées a l’intérieur d’une vésicule terminale: sporange qui après éclatement libère les spores
- Exogènes: spores formées par les filaments sporigénes (Condidophores) selon leur mode de formation on distingue:
–les arthrospores: naissent par fragmentation du thalle (ex: Geotrichum)
–Les blastospores: naissent par bourgeonnement du thalle (ex: Candida)
–Les sympodulospores: naissent par bourgeonnement du thalle candidogéne qui reprend sa croissance après formation de chaque spore
–Les chlamydospores: spores de Résistance a paroi épaisse + cytoplasme dense a localisation terminale(C.albicans) ou intercalaire(Dermatophyte)
PS! ZYADA : l’appareil sporigéne (candidogéne) est composé de :
Tige : canidiophore / Renflement: columelle / Filaments courts : Phialides qui produisent les spores appelées Conidies
b- Reproduction sexuée: Rare, conditions de vie défavorables par 2 moyens:
1.Conjugaison de 2 filaments différenciés: aboutit à la production d’une zygospore (cas des zygomycètes)
2.Conjugaison de 2 filaments complémentaires: aboutit à la formation d’un dicaryon (contenant 2 noyaux haploïdes) portant les organes sexués:
- Asques: contenant chacune 8 ascospores (ascomycètes)
- Basides: portant chacune 2-8 basidiospores (basidiomycètes)
V.Biologie: les champignons pathogène sont saprophytes, soit : exosaprophytes (histoplasma capsulatum) ou
endosaprophytes (Candida albicans)
VI.Rôle pathogène :
a.Typologie: Mycoses superficielles: Dermatophytes / Mycoses profondes : Aspergillose
b.Mode de contamination :
-
- Transcutanée : aux faveurs d’une piqure ex : sporothrix schenckii
- Contact direct : contact avec un sujet parasité ex: Teignes
- Contact indirect: marche pieds nus, piscines ex : Dermatophytes
- Effraction cutanée: acte médico-chirurgical
- Respiratoire: inhalation de spores ex histoplasma
VII.Diagnostic Mycologique:
a.Diagnostic direct:
1-prélèvements :
- Conditions du prélèvement : avant TRT ou sous fenêtre thérapeutique
- ∑Prélèvement:
–Lésions de la peau glabre: raclage des squames, Scoth-test
–Lésions unguéales: grattage du tissu unguéal (onyxis dermatophytique), P.sérosité a l’écouvillon + raclage du tissu unguéal (onyxis -périonyxis candidosique)
–Cheveux-poils: au moyen d’une pince à piler, raclage des squames, technique de la moquette (lésions inapparente)
–Exsudats: P. a l’écouvillon
–Liquide biologiques : sang, urines, LCR + Selles + Biopsie
2-examen direct +++ :
- Examen à l’état frais : entre lame et lamelle facilité par l’utilisation d’éclaircissants, d’encre de chine(LCR)
- Examen après coloration
3-Culture:
Isolement + identification des champignons impliqués Développement : levures (10j) – filaments (45j)
4-Antifongigramme (peu de valeur thérapeutique)
b-Diagnostic indirect:
-
- Sérologie: recherche Ac + Ag circulants (IFI+++)
- Biologie moléculaire: PCR (pneumocystis jiroveci +++)
VIII.TRT: antifongique (anti levure/ anti filamenteux) avec risque de toxicité hépatique ou rénale
Source: Amine Babouche
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