Les termes de configuration cis et trans sont dus au fait que la double liaison carbone-carbone peut adopter deux organisations différentes dans l’espace :

1. – lorsque les hydrogènes H sont du même côté, la liaison est dite cis
2. – L’orientation cis ou trans va modifier la structure tridimensionnelle des acides gras, Une double liaison cis crée un coude dans la chaîne carbonée.
3. – Dans la nature, les acides gras ont très majoritairement une orientation cis