C’est un neurotransmetteur dans le système nerveux central et dans les plexus intramuraux du tube digestif, ainsi qu’un autacoïde (hormone locale) libéré par les cellules entérochromaffines et les thrombocytes. se trouve principalement dans la partie médiane du tronc cérébral, à partir duquel elle va irriguer tout le système nerveux. Elle joue donc un rôle essentiel dans l’activité des neurones, dont elle va diminuer la fréquence de décharge, ou encore inhiber l’action.Elle intervient dans la souffrance morale et donc dans la dépression“,. Elle aurait également une action sur le sommeil, les troubles sexuels et alimentaires. Elle est impliquée dans la régulation de fonctions telles que la thermorégulation, les comportements alimentaires et sexuels, le cycle veille-sommeil, la douleur, l’anxiété ou le contrôle moteur. La sérotonine de la mère joue un rôle important dans le développement de l’embryon.